#

KODE KURSUS

INBIO 3

KURSUS DIMULAI

AGUSTUS 2020

KURSUS BERAKHIR

SEPT 2020

ESTIMASI WAKTU BELAJAR

2 JAM/MINGGU

HARGA: Rp. 250.000,-



Tentang Kursus:



Next Generation Sequencing (NGS) yang merupakan teknologi terbaru dalam pembacaan sekuen DNA diantaranya whole genome sequencing, targeted sequencing, dan de novo sequencing. NGS mampu melakukan pembacaan jutaan sekuen basa fragmen DNA dalam satu kali analisis. Single Nucleotide Polymorphism (SNP) adalah salah satu bentuk variasi materi genetik yang ditunjukkan oleh perbedaan nukleotida tunggal (adenina, timina, guanina, sitosina) di dalam susunan rangkaian basa DNA. Pada topik ini akan dibahas dasar-dasar analisis NGS dalam identifikasi SNP




Topik Kursus



MINGGU 1
Pengenalan NGS, SNP, Database SNP

MINGGU 2
Instalasi software pendukung, Quality control dengan FastQC, Cleaning dengan trimmomatic

MINGGU 3
Penjajaran sekuens dengan bowtie

MINGGU 4
SNP Calling dengan BCFTools

MINGGU 5
Analisis SNP Effect dengan SNPEff

MINGGU 6
Tanya jawab/diskusi