Deep Dive into Next-Generation Sequencing

Helena Daten, S.Si., M.Si; Raden Afif Pranaya Jati, M.Sc; A. Dimas Cahyaning Furqon, S.Si

LIVE-OC123
Higher Education 📅 17-18 May / 10.00 - 12.00 WIB 24-25 May / 09.30 - 11.30 WIB 31 May - 1 June / 13.00 - 15.00 WIB
🕘

Harga Course
Rp.500,000


Min. requirements

Course Overview

Masuki dunia analisis genomik secara menyeluruh dengan “Deep Dive into NGS Data”, paket kursus lengkap yang membekali Anda dari hulu ke hilir—mulai dari persiapan dan akuisisi data NGS, analisis tanpa coding menggunakan Galaxy, hingga otomasi workflow profesional dengan Snakemake berbasis Python. Dirancang untuk peneliti, mahasiswa, dan profesional bioinformatika, bundling ini memberikan pemahaman konsep, keterampilan praktis, dan kemampuan teknis yang Anda butuhkan untuk mengelola data NGS secara mandiri, efisien, dan reproducible. Tingkatkan kompetensi Anda dalam satu rangkaian pembelajaran terpadu!

Sub-topics

1. Obtaining NGS Data: From Preparation to Analysis

Sample Preparation and Library Construction

Sequencing Platforms and Data Generation

Raw Data Processing and Quality Control

Basic Analysis: Alignment and Variant Calling

2. Simple Guide to Analyze NGS Data using Galaxy

Introduction to the Galaxy Platform

Uploading and Managing NGS Data

Basic Quality Control and Preprocessing

Read Mapping and Variant Calling with Galaxy Tools

3. Managing NGS Data Analysis with Snakemake: A Python-based Workflow

Learn the basics of Snakemake

How to build a pipeline

Hands-on practice with an NGS analysis workflow

Tips for best practices

Course Components


Video Modul Whatsapp Group