Spatial Transcriptomics: Mapping Gene Expression in Tissue Context

Fadhiil Ansyarullah Murtadho, S.Ked, M.Sc

VIDOC15
Higher Education

8 Students Enrolled

Harga Course
Rp.150,000


Min. requirements

Course Overview

Spatial transcriptomics menghadirkan revolusi baru dalam biologi molekuler dengan memetakan ekspresi gen langsung di dalam konteks jaringan. Spatial transcriptomics adalah teknologi frontier yang semakin banyak digunakan dalam riset kanker, neurobiologi, dan terapi presisi. Dengan menguasainya, Anda akan mampu memahami interaksi sel dalam lingkungan jaringan secara lebih mendalam dan membuka peluang penelitian di bidang biologi, kesehatan, dan bioteknologi yang sedang berkembang pesat. Course ini akan membekali Anda mulai dari konsep dasar, eksplorasi data, preprocessing & quality control, hingga integrasi dengan scRNA-seq dan analisis menggunakan tools populer seperti Seurat, Scanpy, dan Squidpy.

Sub-topics

- The Fundamentals of Spatial Transcriptomics
- Data Exploration Basics
- Preprocessing & Quality Control
- Integration with scRNA-seq
- Analysis using Seurat/Scanpy + Squidpy
- Interpretation, Application, and Advanced Approaches

Course Components


Video Modul Whatsapp Group