Next-Generation Sequencing for Pharmacogenomics
Inna Armandari, Ph.D
VIDOC22
0 Students Enrolled
Harga Course
Rp.150,000
Min. requirements
Course Overview
Kursus ini dirancang untuk memberikan pemahaman menyeluruh mengenai bagaimana teknologi Next-Generation Sequencing (NGS) diterapkan dalam bidang farmakogenomik (PGx). Peserta akan mempelajari alur lengkap mulai dari dasar-dasar NGS dan PGx, pemilihan gen target, proses wet-lab, hingga analisis bioinformatika dan interpretasi varian untuk menghasilkan laporan klinis yang siap digunakan dalam pengambilan keputusan terapi.
Sub-topics
1. Introduction to Pharmacogenomics and NGS Technologies
Pengenalan konsep dasar farmakogenomik, peran genetik dalam respons obat, serta prinsip kerja berbagai platform NGS yang umum digunakan dalam analisis PGx.
2. Target Genes and Panels in Pharmacogenomics
Pembahasan gen-gen kunci dalam PGx, pertimbangan dalam penyusunan panel, serta standar klinis dan rekomendasi global (CPIC, DPWG).
3. Wet-Lab Workflow for Pharmacogenomics NGS
Panduan praktis mengenai alur wet-lab, termasuk ekstraksi DNA, library preparation, target enrichment, proses sequencing, dan kontrol kualitas pada level laboratorium.
4. Bioinformatics Pipeline: Alignment, Variant Calling, and QC
Penjelasan langkah-langkah komputasi dari raw data FASTQ hingga VCF, termasuk read alignment, variant calling, annotation, dan metrik QC yang penting dalam PGx NGS.
5. Pharmacogenomic-Specific Variants
Pemahaman mengenai jenis-jenis varian yang relevan secara klinis (SNP, indel, CNV, star alleles), serta bagaimana varian tersebut memengaruhi metabolisme obat dan respons pasien.
6. Translating NGS Output into Usable PGx Reports
Cara mengonversi hasil analisis NGS menjadi laporan farmakogenomik yang mudah dibaca klinisi, termasuk interpretasi genotype–phenotype dan rekomendasi terapi berbasis pedoman internasional.
Course Components
Video Modul Whatsapp Group